甜叶菊一般不会明显干扰药物吸收，但某些特定情况下可能存在潜在影响。甜叶菊作为天然甜味剂，其主要成分甜菊糖苷在常规使用量下通常被认为是安全的，但个体差异或与特定药物联用时需谨慎。
目前尚无充分证据表明甜叶菊会普遍影响药物吸收。甜菊糖苷主要通过肠道代谢，其代谢产物主要通过肾脏排泄，与多数药物代谢途径不产生直接竞争。对于常规剂量的慢性病药物如降压药或降糖药，正常食用甜叶菊制品通常不会显著改变血药浓度。需要注意的是，某些特殊剂型药物如缓释制剂，其吸收过程可能受膳食纤维或肠道环境改变的影响，但这种情况与甜叶菊本身无直接关联。
特殊情况下，大剂量摄入甜菊糖苷可能影响特定药物的代谢。体外研究表明，高浓度甜菊糖苷可能轻微抑制细胞色素P450酶系中的CYP3A4亚型，该酶参与约50%临床药物的代谢。涉及该代谢途径的药物包括部分他汀类降脂药、钙通道阻滞剂以及免疫抑制剂等，但实际临床意义尚未明确。建议长期服用上述药物的患者，若每日摄入甜叶菊提取物超过4毫克/千克体重时，应咨询医师进行用药监测。
日常使用甜叶菊作为代糖时，建议与药物服用间隔1-2小时。正在接受抗凝血治疗或使用窄治疗窗药物（如华法林）的患者，应特别注意任何饮食改变对药物效果的影响。若出现异常症状或怀疑存在相互作用，应及时联系主治医师进行血药浓度检测或剂量调整。