吴茱萸可能对慢性肾炎有一定的辅助作用，但不能作为主要治疗手段。其功效多基于传统中医理论及初步研究，实际疗效需结合个体情况综合评估。
吴茱萸含有挥发油、生物碱等成分，现代药理学研究表明其具有抗炎、调节免疫等作用。在动物实验中，吴茱萸提取物显示出减轻肾脏炎症反应的潜力，可能通过抑制炎症因子释放发挥保护作用。但针对慢性肾炎患者的临床研究数据有限，目前缺乏高质量循证医学证据支持其确切疗效。
从中医辨证施治角度，吴茱萸主要适用于寒湿困肾型患者。该药材性热味辛苦，归肝、脾、胃、肾经，对于伴有腰膝冷痛、四肢不温等症状的患者，配伍使用时可能改善部分不适。但需注意湿热蕴结型患者使用可能加重病情，需严格辨证使用。
慢性肾炎患者应遵循规范诊疗方案，包括控制血压（常用氨氯地平、缬沙坦等）、降低蛋白尿（如使用贝那普利）、调节免疫（如他克莫司）等治疗。日常需保持低盐优质蛋白饮食，建议每周复查尿常规，每3个月评估肾功能变化。若考虑联合中药治疗，应在肾内科医师和中医师共同指导下进行，避免自行用药影响病情。