经期性行为可能增加妇科疾病的发生风险，但并非绝对。经期女性免疫力相对较低，宫颈口开放，容易因卫生问题或细菌侵入导致感染，诱发阴道炎、宫颈炎等疾病。若未做好防护措施，还可能增加其他并发症的风险。
经期性行为可能因卫生问题导致病原体侵入阴道。月经期间阴道内环境改变，血液作为细菌的培养基，若未注意清洁或存在不洁性接触，可能引发细菌性阴道炎、外阴炎等感染性疾病。此外，性行为时可能将外界细菌带入宫腔，增加子宫内膜炎或盆腔炎的风险。
经期性生活可能增加子宫内膜异位症风险。性行为过程中子宫收缩可能促使经血逆流至盆腔，脱落的子宫内膜细胞在盆腔种植，可能引发痛经、性交痛等症状。这种情况多见于本身有子宫位置异常或经血排出不畅的女性。
经期性行为还可能影响生殖系统修复。月经期子宫内膜处于脱落修复阶段，此时性刺激可能影响血管收缩和修复进程。部分女性在经期最后两天血量较少时同房，仍可能因残留经血导致感染概率上升。
建议尽量避免经期性行为，若需同房应做好清洁防护，使用避孕套减少交叉感染风险。性行为后及时清洗外阴，避免盆浴。若出现异常分泌物、下腹疼痛或发热等症状，应及时到妇科就诊检查。日常注意经期卫生护理，勤换卫生用品，保持外阴干燥清洁。