爱地那非与西地那非的耐受性差异需要根据个体反应和药物特性综合判断，不能一概而论。西地那非作为较早上市的PDE5抑制剂，其副作用发生率和耐受性已有较多研究数据支持，而爱地那非可能因剂量或代谢差异在某些情况下表现不同。
西地那非常见副作用包括头痛、面部潮红、消化不良等，多为一过性且程度较轻。随着剂量增加，部分患者可能出现视觉异常或心悸。爱地那非作为结构类似药物，其副作用谱与西地那非相近，但部分临床数据显示低剂量爱地那非的鼻塞发生率相对较低，可能与药物选择性差异有关。
个体对药物的代谢差异显著影响耐受性，CYP3A4酶活性、肝肾功能状态都会改变药物清除率。有研究表明，西地那非的绝对生物利用度约为40%，而爱地那非可能因分子结构优化具有更稳定的药代动力学特征。但具体耐受性比较仍需更多循证医学证据支持。
建议在医生指导下进行药物选择，根据基础疾病、合并用药等情况制定个体化方案。使用前需详细评估心血管风险，避免与硝酸酯类药物联用。用药期间出现持续头痛或视力改变应及时就医，定期监测血压和心率变化有助于评估耐受性。