科兴疫苗一般不会导致长期后遗症。根据现有临床数据，其常见不良反应多为接种后短期内出现的一过性反应，属于正常免疫应答现象。绝大多数接种者在48小时内症状即可缓解，极少数可能出现持续数日的不适，但尚未发现与疫苗相关的永久性后遗症。
1、正常免疫反应
科兴疫苗作为灭活疫苗，接种后可能出现注射部位疼痛（82.7%）、乏力（61.5%）、头痛（52.2%）等反应，这些症状多在接种后24小时内出现，通常持续1-3天自行消退。世界卫生组织监测数据显示，这些局部和全身反应发生率与其他灭活疫苗相当。
2、罕见严重反应
严重过敏反应发生率约为百万分之二，主要出现在接种后30分钟内。心包炎、心肌炎等严重不良反应全球报告率低于0.01%，且多发生于接种后14天内。我国疫苗接种不良反应监测系统显示，严重异常反应发生率低于国际平均水平。
接种后建议留观30分钟，注意休息并保持接种部位清洁。若出现持续高热（超过39℃）、呼吸困难或心悸等症状，应及时就医。目前全球已接种超26亿剂科兴疫苗，长期安全性监测数据显示其与慢性疾病发生无因果关系，接种者无需过度担忧后遗症风险。