碳酸钙与磷酸钙在化学成分、应用领域及生理作用等方面存在一定区别，通常可以从化学组成、来源、应用领域、吸收效果、副作用等方面进行区分。具体选择需根据个人需求，在医生指导下使用。
1、化学组成
碳酸钙的主要成分是碳酸根和钙离子，化学式为CaCO₃；磷酸钙则含有磷酸根和钙离子，化学式通常为Ca₃(PO₄)₂。两者在溶解度和稳定性上存在差异，碳酸钙在酸性环境中更易溶解，而磷酸钙在中性环境中溶解度较低。
2、来源
碳酸钙广泛存在于石灰石、贝壳等天然矿物中，也常用于钙补充剂；磷酸钙则主要存在于骨骼和牙齿中，人体内约85%的磷以磷酸钙形式存在。食品添加剂或医用材料中的磷酸钙多通过化学合成获得。
3、应用领域
碳酸钙常用于治疗钙缺乏症、胃酸过多，以及作为食品强化剂；磷酸钙在骨科领域应用较多，如骨缺损修复材料、牙科填充材料等。两者在药物剂型上也有差异，碳酸钙多为片剂或咀嚼片，磷酸钙常制成骨水泥或涂层材料。
4、吸收效果
碳酸钙的吸收依赖胃酸环境，胃酸分泌不足者吸收率可能下降至10%-20%；磷酸钙的吸收不受胃酸影响，但整体吸收率较低，约为25%-30%。两者均需配合维生素D使用以提高生物利用率。
5、副作用
碳酸钙可能引起便秘、腹胀等消化道反应，长期过量服用可能导致高钙血症；磷酸钙过量摄入可能影响铁、锌等微量元素的吸收，肾功能不全者需慎用。临床使用中需根据患者肾功能、胃酸分泌情况综合评估。
日常补钙建议优先选择碳酸钙制剂，因其钙含量较高（含钙量40%），且性价比更优。但对于胃酸缺乏或肾功能异常患者，可考虑改用磷酸钙或其他有机钙制剂。使用任何钙剂前应检测血钙、尿钙水平，避免与其他含钙药物同时服用。