野艾蒿作为中药材使用可能引起皮肤过敏、胃肠道不适、肝损伤等副作用，特殊人群使用时需特别注意。其辛温燥烈的特性可能对部分体质人群产生不良反应，需在专业指导下合理应用。
野艾蒿含有挥发油等成分，部分人群接触后可能出现皮肤瘙痒、红斑或丘疹等过敏反应。体质敏感者接触新鲜植株或未经炮制的药材时，更易出现此类症状，严重时可发展为接触性皮炎。
其药性辛温可能刺激消化道黏膜，部分患者使用后会出现恶心呕吐、腹部隐痛或腹泻等胃肠道反应。这种刺激作用在空腹服用或超大剂量使用时尤为明显，可能影响消化系统正常功能。
长期或过量使用野艾蒿可能对肝脏代谢造成负担，临床有个案报道显示连续服用数月后出现转氨酶升高。药材中含有的某些脂溶性成分可能在体内蓄积，影响肝细胞正常生理功能。
孕妇使用可能引发子宫收缩，存在流产风险。哺乳期妇女使用后，药物成分可能通过乳汁影响婴儿发育。阴虚火旺体质人群使用后可能加重潮热盗汗、口干舌燥等虚热症状。
使用野艾蒿出现任何不适症状应立即停用。建议在中医师指导下控制用药剂量与疗程，连续使用不宜超过两周。肝肾功能异常者需慎用，使用期间建议定期监测相关生化指标。药材应选择正规渠道的炮制品，避免自行采集新鲜植株使用。