二氧化氯是否对眼睛有刺激通常取决于浓度和接触时间。高浓度或长时间接触可能产生刺激，低浓度且短暂接触一般无明显刺激，但需注意防护。
高浓度接触时，二氧化氯的强氧化性可能损伤眼部组织。其挥发性成分会与眼表黏膜发生反应，引发烧灼感、流泪和结膜充血等症状。工业场所使用浓度超过0.1ppm时，建议佩戴全封闭式护目镜。曾有实验数据显示，暴露于1ppm浓度下超过15分钟，78%受试者出现眼部不适。
低浓度接触时刺激风险较低，但存在个体敏感性差异。日常消毒使用的0.01%-0.02%溶液在正常操作下通常安全，但溶液溅入眼内仍需立即处理。过敏体质人群可能出现异常反应，表现为眼睑水肿或畏光加重等情况。
接触二氧化氯后应立即用生理盐水冲洗眼睛至少15分钟，转动眼球确保结膜囊充分清洁。若佩戴隐形眼镜需先摘除再冲洗。冲洗后使用人工泪液可缓解不适，但出现持续疼痛或视力改变应及时就诊眼科。日常操作建议在通风环境进行，保持安全距离避免蒸汽直扑面部的风险。