莫匹罗星软膏长期使用可能引起皮肤刺激、过敏反应以及耐药性等副作用，需避免自行延长用药时间。该药物作为外用抗生素，一般建议短期使用以降低不良反应风险。
1、皮肤刺激
长期涂抹莫匹罗星软膏可能引发局部灼热感、瘙痒或干燥脱皮。这些症状多因药物成分持续刺激皮肤屏障导致，在皮肤较薄的眼睑、口唇等部位更易发生。研究显示超过7天连续使用会使皮肤刺激发生率提高约12%。
2、过敏反应
部分患者可能出现接触性皮炎，表现为用药部位红斑、丘疹或渗出。这与个体对聚乙二醇等辅料过敏有关，临床统计显示发生率约为3%-5%。过敏体质者首次使用后24小时内可能出现迟发型超敏反应。
3、耐药性风险
持续使用超过10天可能诱导耐药菌株产生。莫匹罗星通过抑制细菌异亮氨酸-tRNA合成酶发挥作用，金黄色葡萄球菌在药物压力下易产生mupA耐药基因，导致治疗失败率上升17%-23%。
使用莫匹罗星软膏应严格遵循医嘱，通常疗程不超过10天。若出现明显烧灼感或皮疹加重，需立即停用并清洁药物残留。对于反复感染的皮肤病灶，建议进行细菌培养和药敏试验，避免盲目延长抗生素使用时间。哺乳期妇女乳房部位用药前应咨询医生，防止婴儿经口摄入药物。