枯草杆菌二联活菌颗粒作为益生菌制剂，一般副作用较少，但部分人群可能出现胃肠道不适、过敏反应或感染风险等。用药期间需注意观察身体反应，必要时就医处理。
1、胃肠道不适
部分患者用药初期可能出现腹胀、腹痛或腹泻加重等症状。这通常与活菌在肠道内定植过程中暂时改变菌群平衡有关，多数症状会随着用药时间延长逐渐缓解。若症状持续或加重，建议暂停用药并咨询医生。
2、过敏反应
极少数过敏体质者可能出现皮疹、皮肤瘙痒等过敏表现。这类反应通常与个体对药物成分敏感有关，需立即停药并及时进行抗过敏治疗，如遵医嘱使用氯雷他定片、西替利嗪胶囊等药物。
3、感染风险
免疫功能严重低下者长期使用活菌制剂时，可能存在细菌易位的潜在风险。这类患者肠道屏障功能较弱，活菌可能通过肠黏膜进入血液循环引发感染。因此，免疫缺陷患者使用前需严格评估用药指征。
使用枯草杆菌二联活菌颗粒时，应注意与抗菌药物间隔2小时以上服用。储存时应避光密封，保持活菌活性。若用药后出现持续性腹痛、血便或发热等异常情况，应及时到消化科就诊。特殊人群如早产儿、肿瘤患者使用前应咨询医师，确保用药安全性。