高压氧舱治疗通常可能导致耳压变化，尤其在加压和减压阶段更为明显。多数患者在治疗过程中可能出现耳部闷胀感或轻微疼痛，但通过正确方法可有效缓解。
高压氧舱治疗时外界气压快速变化会影响中耳腔压力平衡。当加压阶段外界气压升高时，若咽鼓管未能及时开放调节压力，鼓室内外压力差会导致鼓膜内陷，出现耳闷、耳鸣等症状。减压阶段气压下降过快时，也可能因中耳气体膨胀导致不适。患者可通过吞咽动作、捏鼻鼓气等方式促进咽鼓管开放，帮助平衡耳压。
部分患者因鼻咽部炎症、过敏性鼻炎等导致咽鼓管功能障碍时，更易出现耳压相关症状。这类人群在治疗前可使用生理盐水冲洗鼻腔，必要时遵医嘱使用盐酸赛洛唑啉鼻喷雾剂等减充血剂改善鼻腔通气。儿童因咽鼓管发育未完善，发生耳压不适的概率相对成人更高。
治疗过程中若出现明显耳痛或听力变化，应立即告知操作人员暂停加压并协助调压。操作人员会根据患者耐受度调整加压速度，必要时采用阶段性加压方式。绝大多数耳压相关症状在治疗后数小时内自行消失，极少数出现持续耳鸣或听力下降者需耳鼻喉科专科检查。