黄柏通常可以作为牙周炎的辅助治疗方式，但不能替代常规治疗。牙周炎的治疗需结合病因进行综合处理，黄柏仅能通过其药理特性对某些症状产生缓解作用，具体疗效因人而异。
黄柏含有小檗碱、黄柏酮等成分，具有广谱抗菌作用，能抑制牙周致病菌如牙龈卟啉单胞菌的繁殖。其抗炎特性可减轻牙龈红肿热痛，体外实验显示对牙周袋内炎症介质PGE2的合成有抑制作用。该药材还能收敛止血，对牙龈出血症状有一定改善效果，但无法清除已形成的牙结石或修复受损牙槽骨。
牙周炎的治疗需通过超声洁治术去除菌斑和牙石，严重者需进行龈下刮治或牙周翻瓣手术。药物治疗方面，临床常用盐酸米诺环素软膏、甲硝唑含漱液等局部给药，中重度感染需联合阿莫西林克拉维酸钾口服。日常需使用巴氏刷牙法并配合牙线清洁，每半年接受一次专业牙周检查。
若出现牙龈退缩、牙齿松动等情况，应及时到口腔专科医院就诊。牙周基础治疗后3个月需复查探诊深度，活动义齿佩戴者每日需用义齿清洁片浸泡。黄柏煎液漱口前需经中医师辨证，孕妇及过敏体质者慎用，避免与含碘含氟类漱口水同时使用。