男性生殖器疱疹一般可以挂皮肤性病科、皮肤科或泌尿外科就诊。不同医院的科室设置可能存在差异，具体挂号需结合个人症状及医院实际情况进行选择。
1、皮肤性病科
皮肤性病科是专门诊治性传播疾病的科室，对于生殖器疱疹这类由单纯疱疹病毒引起的性传播疾病具有丰富的诊疗经验。医生可通过视诊观察外生殖器、肛门周围的水疱或溃疡形态，结合实验室检查如病毒抗原检测、病毒培养等方法明确诊断。
2、皮肤科
部分医院未单独设置皮肤性病科时，皮肤科可接诊生殖器疱疹患者。该科室医生熟悉皮肤黏膜病变的鉴别诊断，能够针对疱疹引起的局部红斑、水疱、糜烂等症状给予对症处理，例如开具抗病毒药物或外用制剂缓解疼痛和促进创面愈合。
3、泌尿外科
若疱疹累及尿道口或伴随排尿疼痛、尿频等泌尿系统症状，可选择泌尿外科就诊。医生会评估是否存在继发细菌感染或其他并发症，必要时进行尿常规、尿道分泌物检测等辅助检查，并制定相应的抗病毒及对症治疗方案。
建议患者选择正规医疗机构就诊，如实向医生描述病史和症状。就诊时需注意个人防护，避免与他人共用毛巾等物品，同时应配合医生进行性伴侣的健康管理，防止疾病传播。