巧克力的主要成分包括可可固形物、糖类、脂肪以及少量蛋白质、膳食纤维等，其营养成分根据种类不同有所差异。适量食用黑巧克力可能对身体有一定益处，但需注意控制摄入量。
巧克力的核心成分是可可制品，其中黑巧克力的可可含量较高，通常含有黄烷醇等抗氧化物质。这些多酚类化合物有助于中和自由基，可能对心血管健康产生积极影响。牛奶巧克力额外添加乳固体成分，含有更多钙和乳蛋白，但糖分含量也相应提高。白巧克力虽以可可脂为基础，但缺乏可可固形物中的活性成分，主要提供脂肪和糖分。
巧克力中的矿物质含量值得关注，每100克黑巧克力可提供约230毫克镁，占成人日需量的60%，同时含有铁、锌等微量元素。可可脂中的脂肪酸以硬脂酸为主，这种饱和脂肪酸代谢方式较特殊，对胆固醇水平影响较小。但市售产品常添加棕榈油等植物油脂，可能改变脂肪酸构成比例。
需要特别注意市售巧克力多属于高糖高脂食品，普通牛奶巧克力每100克含糖量可达50克以上。建议选择可可含量70%以上的黑巧克力，每日摄入量控制在25-30克为宜。食用时注意口腔清洁，糖尿病患者及控制体重人群应谨慎选择低糖产品，对咖啡因敏感者避免晚间食用。