支原体肺炎一般不会导致死亡，但少数患者可能因严重并发症或基础疾病而危及生命。该病多数情况下预后良好，及时规范治疗通常可有效控制病情。
支原体肺炎属于非典型肺炎，主要累及呼吸道。多数患者表现为发热、干咳、乏力等症状，病程多在2-4周，经大环内酯类抗生素如阿奇霉素、罗红霉素或喹诺酮类药物如左氧氟沙星治疗后，症状可逐渐缓解。对于免疫功能正常且无基础疾病的患者，病情进展为重症的可能性较低。
但合并免疫缺陷、慢性心肺疾病、恶性肿瘤等基础疾病的患者，可能因肺部广泛实变引发呼吸衰竭，或继发脓毒症、多器官功能障碍综合征。婴幼儿因气道狭窄易发生喘息，老年人因代偿能力差可能出现病情急剧恶化。这类高危群体若未及时接受呼吸支持、糖皮质激素等综合治疗，可能出现生命危险。
确诊支原体肺炎后应尽早开始抗感染治疗，体温持续不退或出现胸闷气促时应立即复诊。建议患者保持充足休息，保证蛋白质和维生素摄入以增强免疫力。特殊人群出现呼吸道症状时，建议尽早就医评估病情。