手足口和疱疹性咽颊炎的区别主要是传播途径不同、发病部位不同、病毒分型不同。
1、传播途径不同：手足口病主要是通过肠道进行传播，也有可能会通过疱疹的疱液进行传播，疱疹咽峡炎主要是通过呼吸道或者是消化道进行传播。
2、发病部位不同：手足口病一般会出现在口腔和咽喉部，而且还会出现在手筋或者是脚筋等部位。疱疹性咽峡炎主要会出现在口腔部的病变。
3、病毒分型不同：有文献报道这两种疾病虽然都是属于柯萨奇A组病毒传染的疾病，但是病毒的分型亚型有不同。