男孩身高发育迟缓可能是遗传因素、营养不良或者生长激素不足等原因所致，具体原因存在个体差异。
1、遗传因素：孩子的身高受遗传因素影响，若父母的身材比较矮小，孩子就比较容易出现发育迟缓的情况。
2、营养不良：孩子生长发育阶段对各种营养物质的需求量比较大，如果长期营养摄入不充足导致营养不良，也会影响正常生长发育。
3、生长激素不足：孩子长期睡眠不足、遗传因素以及垂体瘤等原因导致生长激素分泌不足时，也会使孩子出现生长发育迟缓的情况。
男孩出现高发育迟缓的情况时，需要到医院做微量元素检测、生长激素检测、染色体检查以及颅脑CT等检查，明确诱因后对症治疗。