孩子扁桃体发炎一般不能打新冠疫苗，建议等病情好转以后再进行注射。
如果服用抗菌消炎药物，处于扁桃体急性发炎的状况或伴有发热，表示患者身体抵抗力下降，此时注射疫苗后可能会发生一些不良反应，容易诱发其他病变。而且有些人注射疫苗后会出现发热反应，就有可能会导致扁桃体的炎症加重，个人的体质不同，注射疫苗后出现的不良反应也是不同的，并不能百分百排除不良反应。
如果扁桃体有炎症，最好先控制炎症后，再去注射，以免注射疫苗后引起发热，导致病情加重。