新生儿大便有酸臭味可以调整饮食结构、按摩、口服益生菌等，需要加以重视积极治疗。
1、调整饮食：新生儿大便有酸臭味诱发因素可能是消化不良，如果病不受益特别严重，可以通过调整饮食结构，多喝温开水能够起到减轻作用。
2、按摩：通过对腹部适当按摩，也可以起到幅度促进消化作用，例如手掌打开放置于新生儿肚子部位，一般会选择绕着肚脐顺时针按摩，能够帮助肠道蠕动。
3、口服益生菌：益生菌可以起到调节肠道作用，也可以在医生指导下减轻症状，主要是针对大便有酸臭味症状比较严重，有一定治疗作用。
除以上治疗方法，在平时还需要避免着凉等，配合医生治疗，防止加重。