新生儿磁共振检查脑部一般是没有任何影响的，不会对身体健康造成威胁。
核磁共振检查属于一种比较常见的检查方式，是经过比较强的磁场对人体形成的磁场信息进行接触，从而可以查看脑部的一些病变，可以用于诊断脑部是否出现出血或者脑梗塞等，同时也可以用于判断有没有出现脑部肿瘤，准确性相对来说是比较高的。
新生儿做核磁共振检查的时候，一般需要在完全安全下才可以做检查，必要的时候也需要打一些镇静剂，这样才可以使检查结果更加准确。