怀孕20天肚子隐隐作痛可能是生理性的，也有可能是先兆流产或宫外孕等病理性因素引起，需要根据原因对症处理。
一、生理性：怀孕20天时受精卵可能刚在子宫内壁上着床，会使体内多种激素水平发生比较大的变化，还会使身体变得敏感，进而诱发肚子隐隐作痛的情况。
二、病理性：
1.先兆流产：怀孕20天属于孕初期，这时胚胎着床通常还不太稳定，受到外界刺激时可能会引发先兆流产，导致出现肚子痛的情况，需要及时到医院保胎治疗。
2.宫外孕：宫外孕是指受精卵在子宫腔以外的部位着床，以输卵管妊娠最为常见，会诱发停经，腹痛及阴道流血等症，需要遵医嘱用药或手术终止妊娠。