怀孕后有深褐色分泌物一般是胚胎着床、先兆流产、宫外孕等。
1、胚胎着床：女性在怀孕早期的时候，胚胎正处于着床的状态，有可能会对子宫壁产生一定的刺激，容易导致阴道有褐色分泌物的排出，属于正常现象。
2、先兆流产：如果在怀孕期劳累过度或者是有性生活，有可能会导致先兆流产，而且也会导致阴道有褐色分泌物，要积极地保胎治疗。
3、宫外孕：主要是指精子和卵子在子宫外着床所致，容易引起腹痛或者是阴道有褐色分泌物的排出，应该及时的终止妊娠。
除了上面这几种原因之外，也不排除是患有了严重的妇科疾病。