婴儿肠道菌群失调的症状消化不良，通常会表现出刺激性的恶心、呕吐、食欲下降、腹痛、腹胀等，同时也会伴有精神不振、身体乏力等症状。
婴儿肠道菌群失调轻重程度不同，所以表现出的临床症状不同，菌群失调的原因有多种，可能是因为不恰当的饮食因素，也有可能是因为出现了先天性肠道发育不好。
婴儿肠道菌群失调通常需要配合医生通过调理肠道内菌群的药物治疗，比如乳酸杆菌三联活菌片、双歧杆菌二联活菌片等，有助于正常的肠道功能恢复。