宝宝喉咙有疱疹，可能是由于手足口病或者疱疹性咽峡炎等原因引起的，建议根据不同的病因采取不同的治疗方式。
1、手足口病：症状通常表现为咳嗽，发热，口腔长疱疹等，建议家长在医生的指导下给宝宝口服抗病毒口服液，利巴韦林颗粒等药物进行治疗。
2、疱疹性咽峡炎：通常表现为咽痛发热，咽部长疱疹等，建议家长在医生的指导下给宝宝使用蒲地蓝消炎口服液或者伐昔洛韦颗粒等药物进行治疗，在平时外出时，注意戴好口罩，避免造成交叉感染。