宝宝屁股上长小水泡通常是由多种因素引起的，比如尿布疹、湿疹、手足口病、水痘，可以到医院进行检查诊断，并采取合适的治疗方法。
1、尿布疹：尿布疹可能是由于长时间的使用尿不湿或者是非棉质的尿布所引起的，会导致局部受到刺激，所以会长水泡。可以局部涂抹红霉素软膏治疗能够促进恢复，还要注意保持皮肤干爽。
2、湿疹：湿疹通常与遗传或者是过敏性因素有关，可能会导致屁股上长丘疱疹或者是脓疱，所以会有水泡，还会伴有瘙痒。可以外用炉甘石洗剂治疗，严重者可以涂抹地塞米松软膏，能够抗炎止痒。
3、手足口病：手足口病通常是由于肠道病毒感染所引起的一种疾病，通常会导致皮肤上有水泡，会长在手心、脚心或者是臀部等部位，还会伴有发烧。手足口病通常需要配合医生使用利巴韦林等抗病毒的药物进行改善，还需要对症治疗。
4、水痘：水痘主要是由于病毒感染引起的，可能会导致身体上长很多的小水泡也会长在臀部，还会引起发烧以及皮肤瘙痒。可以外用炉甘石洗剂治疗，能够缓解症状，免疫力低下者可以口服阿昔洛韦等抗病毒的药物。