怀孕初期孕酮低可能是生理性因素、有流产史、甲状腺功能失调等原因导致，需要到医院进行相关检查。
1、生理性因素：孕酮是属于一种释放性的激素，可能会在不同的时间测量，数值也会有比较大的变化。
2、有流产史：女性在怀孕前做过宫腔操作，比如流产史，对子宫的内膜会造成影响，而且在怀孕的过程中也可能会导致孕酮降低。
3、甲状腺功能失调：怀孕初期甲状腺功能失调，身体就会出现胰岛素抗体，从而会导致孕酮低。
除此之外，也有可能是环境病毒感染等原因所引发。