怀孕出现流褐色分泌物有可能是先兆流产、宫外孕、胎停等原因，要根据原因对症治疗。
1、先兆流产：怀孕期间孕酮分泌不足或者身体过度劳累情况下，可能会引起先兆流产，容易使身体出现下体流褐色分泌物等症状。可以在医生指导下使用黄体酮胶囊、地屈孕酮片、黄体酮针剂等药物保胎治疗。
2、宫外孕：一般是胚胎着床在了子宫以外，多数会着床在输卵管部位容易导致输卵管黏膜出现破裂和引起下体流褐色分泌物或是出血。可以通过药物保守或是通过微创手术等方式终止妊娠。
3、胎停：多数是胚胎先天性发育不良或是宫腔感染等原因，容易导致怀孕期间出现胎停和引起褐色分泌物症状。可以遵医嘱使用药物流产或是通过人流手术等方式终止妊娠。
除以上常见原因以外，也可能是出现了宫颈糜烂、宫颈息肉等原因，需要做相关检查和治疗。