怀孕三个月羊水破了的原因可能是宫颈松弛、生殖道感染、胎儿发育异常等原因所引起的。
1、宫颈松弛：宫颈松弛可能是宫颈机能不全，会导致宫颈含纤维组织、弹性纤维及平滑肌等均较少，或由于宫颈内口纤维组织断裂，使宫颈呈病理性扩张和松弛，导致羊水破了。
2、生殖道感染：生殖道感染大多是因为微生物感染引起的胎膜炎，可能会产生降解酶，使胎膜局部的扩张能力下降而出现破裂。
3、胎儿发育异常：怀孕期间如果胎儿出现发育异常的情况，可能会出现流产，所以在三个月的时候羊水会破。