三个月婴儿囟门跳动通常属于正常的，可不用过于担心。建议在出现异常跳动情况时，及时带婴儿就医治疗。
囟门指婴幼儿颅骨结合不紧所形成的颅骨间隙，可分为前囟和后囟，并且用手触摸前囟门时，有时会感觉到脉搏像脉搏一样，属于正常的现象。囟门的闭合受颅骨的骨化和脑组织发育影响，正常情况下，宝宝出生时后囟很小或已闭合，仅能容一指尖的大小，生后6个月，随着颅骨逐渐骨化而渐渐变小，通常在1岁～1岁半闭合，所以三个月婴儿囟门跳动属于正常的。
如果在一岁半之后还没有闭合，建议及时到医院进行相关检查，并给予治疗。