新生儿大便异常要明确原因治疗，可能是肠胃功能发育不完善、饮食刺激、腹部着凉、肠道内菌群紊乱、肠炎等原因，需要做进一步的检查。
1、肠胃功能发育不完善：这是正常的生理现象，一般不需要干预治疗。
2、饮食刺激：吃的奶粉过凉可能会引起大便稀释，需要吃温热的奶粉。
3、腹部着凉：肚脐周围保暖不到位，着凉以后可能会引起腹泻的症状，可以通过热敷的方法来改善。
4、肠道内菌群紊乱：肠道内有益菌缺乏会导致肠道的消化能力异常，可能会引起大便异常，可以通过针灸的方法来改善。
5、肠炎：受到了细菌感染引起的肠道内膜充血，可能会引起消化能力异常，容易引起新生儿大便异常，可以在医生的指导下使用阿莫西林颗粒、罗红霉素颗粒、头孢克肟颗粒等药物。
在用药治疗期间要定期复查，如果存在较严重的副作用，需要对症处理。