婴儿嘴巴长泡可以通过服用抗病毒类的药物并配合使用抗病毒药膏来治疗改善，也可以通过食用清热去火类的药物来调理，或者是通过调整饮食的方式来达到改善的效果。
1、服用抗病毒类的药物和使用抗病毒药膏：婴儿出现嘴巴上长水泡的情况，可能是受到病毒感染的原因导致，比如疱疹性病毒等，一般需要配合医生通过口服利巴韦林抗病毒药物，并配合涂抹利巴韦林乳膏的方式来达到有效改善的效果。
2、食用清热去火类的药物：婴儿出现嘴巴长水泡的情况，还可能是由于上火的原因导致，一般需要配合医生通过口服清热解毒类的药物来治疗改善，比如蒲地蓝消炎片和健儿清解液以及小儿鼓翘清热颗粒等，都可以有效的达到清热去火和调理身体的效果。
3、调整饮食:除了通过使用药物的方式来达到改善病情的效果外，还需要注意做好饮食方面的调整，尽量多喝水，多吃一些清淡易消化的食物，避免吃辛辣刺激性的食物，以免导致宝宝嘴起泡的症状加重，而影响到恢复和改善，或影响到宝宝的健康。