龟头上有小水泡可能是湿疹、龟头炎、疱疹病毒感染等因素所造成，需要及时治疗帮助病情改善。
1、湿疹：如果局部长时间处于潮湿的状态下，或者不注重皮肤的护理功能，可能会诱发湿疹，导致龟头上面有小水泡，需要在医师指导下通过外用硼酸氧化锌冰片软膏、炉甘石洗剂、布地奈德乳膏等药物治疗，帮助症状改善。
2、龟头炎：龟头炎一般是指龟头不会出现了炎症性感染，在受到炎症的刺激之后，会引起局部有小水疱，需要在医师指导下通过外用红霉素软膏、莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等药物治疗。
3、疱疹病毒：如果不良的生活习惯可能会受到疱疹病毒的感染，诱发带状疱疹会引起局部发热以及有水泡的表现，需要在医师指导下，通过外用喷昔洛韦乳膏、阿昔洛韦乳膏、重组人工干扰素a2d凝胶等药物治疗。
除以上原因以外，龟头上面有小水泡，有可能是受到了滴虫性包皮龟头炎所造成，需要根据病因对症治疗。