包皮手术三个月还痛可能是炎症，但也不排除是由于其他因素所导致。
包皮手术主要是用来改善包茎的，在做完手术以后，需要一段时间才可以完全的恢复，在做完手术三个月以后还痛，可能是由于局部受到了炎症感染的因素所导致，就有可能会导致局部出现疼痛的症状，需要及时地到医院做检查，然后根据检查的结果，可以在医生的指导下使用头孢克肟缓释片、头孢克洛胶囊、青霉素等药物来改善症状。
除了以上比较常见的也不排除是由于前列腺炎等因素所导致的，需要及早的到医院做相关性的检查，对症治疗。