肛门与阴囊之间疼可能是皮肤湿疹、肛门脓肿、肛瘘等因素所造成。
1、皮肤湿疹：皮肤湿疹平时生活中常见的一种皮肤疾病，这种疾病会导致患者的皮肤上出现一些炎症反应，甚至还会伴随着疼痛。生活中应该做好皮肤护理，需要选择炉甘石洗剂、盐酸小檗碱溶液、水杨酸乳膏等药物进行治疗。
2、肛门脓肿：肛门脓肿会导致患者在局部皮肤上出现肿胀，甚至还会伴随着疼痛患者，可以到当地正规的医院，通过手术的方法进行治疗。
3、肛瘘：肛瘘会导致患者的鼻下组织当中出现一些瘘管，甚至还会引起局部的皮肤上出现疼痛。需要到当地正规的医院进行肛瘘再造手术进行治疗。
以上是常见的原因，但也不排除是前列腺炎等因素所造成的，需要完善、检查和治疗。