阴茎根部里面隐隐作痛，可能是由于局部痉挛，长时间挤压等原因引起的。
1、局部痉挛，如果局部发生痉挛，可能会造成阴茎根部隐隐作痛，建议患者多喝水，多排尿，能够起到冲洗尿道的作用，减轻疼痛的症状。
2、长时间挤压，如果平时经常挤压到阴茎根部，可能会造成局部出现隐隐作痛的现象，比如长期久坐或者经常穿紧身衣等，建议在平时养成良好的生活作息习惯，减少对局部的压迫，如果疼痛的症状比较明显，可以在医生的指导下口服止痛的药物进行治疗。