甲亢的危害一：性功能障碍。大约有70%的男性甲亢患者出现性甲亢的危害欲减退或伴有阳痿;75%的女性患者出现月经紊乱或闭经。
甲亢的危害二：肾小管性酸中毒。这是甲亢的危害中比较严重的一点，由于甲亢是一种自身免疫性疾病，其自身免疫病变部位不仅限于甲状腺，也同时发生在肾小管。所以肾小管的病变导致肾小管酸化尿液的功能障碍，即酸性物质不能由肾小管分泌出来随尿液排泄，因此积蓄在血液中而导致酸中毒。
甲亢的其他危害：甲亢控制不好的病人，蛋白质和钙磷代谢负平衡，将发生骨质稀疏。有些甲亢病人主诉骨痛，腰痛，腰椎拍片为压缩性骨折，摔跤跌倒后容易发生骨折。长期甲亢控制不好的病人，各个脏器受到影响，功能衰竭，营养不良，很容易发生感染。在外因(感染，劳累，各种应激)作用下，会发生甲亢危机，表现为高热，腹泻，瞻妄甚至昏迷，合并心衰，休克和黄疸者，预后不佳，死亡率较高。