阴茎根部长有白色小疱一般治疗，外用药物，口服药物治疗等方式进行改善，能够促进症状好转。
1、一般治疗：如果是因为不注重个人的卫生，导致局部受到病原微生物的刺激引起的白色小水疱，建议在平时养成良好的作息习惯，能够促进症状好转。
2、外用药物：如果是因为珍珠疹导致的，可以在医生的指导下通过涂抹红霉素软膏、夫西地酸乳膏等药物促进症状好转。
3、口服药物：如果是因为过敏引起的阴茎根部长有白色小疱，可能需要在医生的指导下，通过口服马来酸氯苯那敏片或盐酸苯海拉明片等药物改善。
对于尖锐湿疣导致的白色小疱，可能需要通过激光或冷冻的方式达到治疗。