男性生殖器里面疼的治疗方法可以通过改善饮食、药物治疗、手术治疗等。
1、改善饮食：如果男性患者的生殖器里面出现疼痛的时候，就可能是因为炎症的原因所引起，不排除是在生活当中经常吃一些辛辣刺激性食物，以及饮食不规律的原因所导致，应该在生活当中多吃一些新鲜的水果和蔬菜，多喝温开水能够对生殖器疼痛起到治疗辅助作用。
2、药物治疗：男性的生殖器出现疼痛的时候，不排除是因为龟头炎症、尿道结石、包皮过长等原因所引起，如果到医院检查确诊是因为龟头炎症的原因所引起，可以在医生的嘱托下通过药物治疗，比如左氧氟沙星胶囊、维生素E、他莫西芬片等药物治疗。
3、手术治疗：患者的生殖器出现疼痛的时候，有可能是因为包皮过长的原因所引起，因为在包皮过长之后里面的污垢以及在清洁的时候不到位，容易出现炎症，所以才会出现生殖器里面疼痛必要时需要到医院通过微创环切手术的方法来治疗。