男性阴茎疼痛通常是外伤、阴茎炎、尿道炎等，需要确定疼痛性质和疼痛具体位置。
1、外伤：男性阴茎受到外力碰撞之后容易有损伤和疼痛感，在性生活过度剧烈的时候也会导致阴茎过度被摩擦，出现疼痛症状，可以遵医嘱适当服用维生素E、头孢克肟片、布洛芬缓释胶囊、洛索洛芬钠胶囊等。
2、阴茎炎：包皮和龟头内部出现慢性炎症之后会诱发阴茎炎，导致局部皮肤出现肿胀和充血现象，会有阴茎疼痛感，严重的会引起皮肤破溃、糜烂、渗出，在医生指导下可以适当使用盐酸左氧氟沙星胶囊、环丙沙星胶囊、红霉素软膏等。
3、尿道炎：出现急性尿道炎会导致尿道黏膜红肿和糜烂，尿道内糜烂面有疼痛的症状，阴茎也会有疼痛感，可以遵医嘱适当服用盐酸左氧氟沙星胶囊、甲硝唑片、红霉素片等。
男性阴茎疼痛除了以上原因之外，还有可能是阴茎硬结症、膀胱炎等。