卵子萎缩怀孕了，说明卵泡萎缩是由于生理因素导致的，而且是不会对怀孕造成影响的。
引起卵泡萎缩的原因有很多，可能是因为内分泌紊乱的原因导致的，也是黄体功能不全引起的，通常分为生理因素和病理因素两种，如果是属于生理性因素导致的，通常是不会对怀孕造成影响的，比如每一个月都会有成熟的卵泡，但并不是所有的卵泡都会发育成熟，有一部分的卵泡在发育的过程中就会出现萎缩，这都是属于正常的生理现象。
怀孕的前三个月之内一定要做好日常的护理，主要是因为怀孕的前三个月卵泡的发育还没有稳定，避免过早的同房，要保持营养均衡，以免引起流产。