怀孕三个月胎儿停止发育可能是胚胎因素、母体因素、环境因素等。
1、胚胎因素：胎儿停止发育有可能是胚胎的质量受到的影响所导致的，出现了染色体异常的情况，就有可能会导致胚胎停育的情况，需要及时的终止妊娠。
2、母体因素：目前如果患有某些严重急性疾病，比如严重的高血压和糖尿病，也有可能会的发育造成胎儿停止发育。需要针对原发病来做治疗和改善。
3、环境因素：如果长时间接触放射性比较强的物质，有可能会影响到胎儿的生长，造成胚胎停止发育的情况。必须要改变生活环境。
除了以上原因也不排除是过度酗酒等因素所导致，要到医院做检查才能明确具体的病因。