卵巢囊肿生理性和病理性一般可以通过临床症状识别，也可以通过辅助检查的方法判断。
生理性囊肿一般不会出现明显的症状，通常是在体检时发现病性囊肿会出现持续性存在，而且随着囊肿的增大，有可能会出现尿频和尿急。另外也可以到医院通过B超检查的方法做进一步的确诊，通过B超能够明确是否是生理性囊肿或者是病理性囊肿。
生理性卵巢囊肿通常是不需要做特殊调整的，一般会随着自身的代谢逐渐的恢复，病理性囊肿需要通过手术的方法做切除治疗，以免导致囊肿出现增大。