小阴唇内侧硬疙瘩疼可能是因为阴唇肥大、尖锐湿疣、脂肪瘤等，需要明确原因以后治疗。
1、阴唇肥大：小阴唇部位如果长时间炎症刺激，引起了局部阴唇肥大，可能会伴有硬疙瘩和疼痛，可以配合医生做手术切除治疗。
2、尖锐湿疣：小阴唇部位如果受到了人乳头瘤病毒感染引起的尖锐湿疣，导致局部有赘生物，可能伴有局部有硬疙瘩和疼痛，可以配合医生做手术切除治疗。
3、脂肪瘤：小阴唇部位如果出现了脂肪瘤，可能会导致局部有压迫性的起疙瘩和疼痛，可以配合医生做开放手术切除治疗。
除了以上原因以外，也可能是纤维瘤等，需要及时的做治疗。