怀孕初期肚子阵痛的原因一般包括生理性疼痛、急性胃肠炎、先兆流产等。建议及时就诊，在医生的帮助下明确病因，并对因治疗。
1、生理性疼痛：可能是怀孕初期受孕囊着床引起的生理性疼痛一般属于正常现象，会自行缓解。
2、急性胃肠炎：可能是怀孕初期饮食不洁，或食用生冷、寒凉食物引起急性胃肠炎，胃肠道黏膜受到刺激引起肠道痉挛导致。
3、先兆流产：可能是身体比较虚弱，怀孕初期体内雌、孕激素水平偏低，或剧烈运动、重体力劳动等引起先兆流产，造成阵发性腹痛导致。
除此以外，还可能是异位妊娠等引起，建议及时鉴别诊断。