输卵管切除的后遗症主要是性功能减退、宫外孕、不孕等。
1、性功能减退：输卵管在切除之后有可能会造成卵巢供血不足，从而导致出现体内的雌性激素分泌不足，也会导致出现性功能减退。
2、宫外孕：如果只是做了单侧的输卵管切除还有一点残留，就有可能会导致宫外孕的发生，而出现宫外孕的发生几率会出现明显的增高，所以在怀孕之后一定要特别的注意。
3、不孕：如果是做了双侧输卵管切除，可能会影响到卵子的排出，也会影响到精子和卵子的结合，从而导致出现无法受孕。