阴道里面有小水疱，一般可以通过做好隐私部位的清洁卫生、口服药物、外用药物等方法进行治疗，使阴道逐渐恢复到健康状态。
1、做好隐私部位的清洁卫生：如果患者是由于不注意个人卫生引起的，一般需要及时做好隐私部位的清洁卫生进行改善，能够避免出现交叉感染。
2、口服药物：如果患者阴道里面有小水疱是由于感染性因素引起的，通常需要遵照医嘱口服药物治疗，比如伊曲康唑或阿昔洛韦片。
3、外用药物：在阴道当中长出小水疱后，是因为药物刺激的原因所引起时，一般需要在医生的指导下外用药物治疗，比如丁酸氢化可的松乳膏或者阿昔洛韦软膏。
除上述之外，当阴道里出现小水疱症状比较严重时，需要及时在医生的指导下通过冷冻方法治疗。