照蓝光治疗黄疸有可能会出现副作用，但是由于每个人的情况是不一样的，所以副作用出现的概率有可能会存在一定的差异，并不能一概而论。
在照射蓝光的过程中如果没有做好眼睛的保护工作，就有可能会对眼睛造成一定的刺激，容易导致眼球出现红肿或者疼痛的症状，而且还有可能会导致视力下降。同时在照射蓝光的过程中，还有可能会导致肠道蠕动的速度比较快，容易造成大便次数增多以及腹泻的症状。
照射蓝光主要能够达到降低体内胆红素的效果，有助于改善黄疸疾病。