真菌感染性鼻窦炎的危害鼻塞和头痛，也可能会影响到正常的嗅觉以及睡眠质量，需要根据医生指导服用药物治疗，严重者也能选择手术治疗。
真菌感染性鼻窦炎会导致鼻窦的黏膜有充血的状况，也会伴随着鼻塞，如果鼻塞比较严重，头部会有短暂性的缺氧，所以也会引起有头痛，同时会影响到患者在平时生活当中的正常睡眠以及在嗅觉上发生改变，要及时到医院去做出有效的诊断和医治。
真菌感染性鼻窦炎在不是特别严重的情况下可以遵医嘱服用头孢克肟颗粒和阿莫西林胶囊，当疾病逐渐加重后可能需要到医院完成手术的方式切除鼻窦部位增生组织。