肛门有脓性分泌物一般是炎症刺激、痔疮、肛瘘等等，还需要做到早发现早治疗。
1、炎症刺激：在不注重肛门卫生的情况下，有可能会导致局部受到炎症的刺激，而且也会导致局部出现疼痛或者是脓性分泌物的排出，可以通过使用高锰酸钾药物清洗来进行改善。
2、痔疮；在痔疮疾病症状比较严重的情况下，可能会导致患者出现疼痛或者是脓性分泌物的排出，还需要通过做手术切除的方法来进行治疗。
3、肛瘘：肛瘘主要会导致肛周出现疼痛，而且也会出现肛周脓肿，因此也会导致脓性分泌物的排出，可以通过使用红霉素软膏、氧化锌软膏、左氧氟沙星软膏通过来进行改善。
除了以上这几种原因之外，也不排除是肛周湿疹等所导致，及时到医院就诊治疗。