头疼眼珠子疼可能是视力疲劳、青光眼、流行性出血热等疾病造成。
1、视力疲劳：在平时生活中，如果长时间熬夜或者是长时间看手机的话，这样就会伴随着视力疲劳，甚至还会伴随着头痛以及眼珠子疼痛。可以在医生的指导下，外用盐酸左氧氟沙星滴眼液、诺氟沙星滴眼液、人工泪液滴眼液等药物进行治疗。
2、青光眼：青光眼会导致患者的眼压出现身高，身体好，会伴随着眼睛疼痛或者是头部的现象。患者应该在医生的指导下使用噻马洛尔滴眼液、布林佐胺滴眼液、匹罗卡品滴眼液等药物进行治疗。
3、流行性出血热：流行性出血热主要是自然疫源性疾病，在发病以后会导致患者的全身出现中毒症状，比如头痛或者是眼眶疼痛。需要到当地正规的医院选择利巴韦林分散片、呋塞米片、更昔洛韦滴眼液等药物进行治疗。
以上是常见原因，也可能和颈椎病有一定的关系，需要对症治疗。